Time Machine hará copias de todos los discos que tu le indiques en sus preferencias y te permitirá tambien excluir cualquier otro disco del que no quieras hacer copia de seguridad.
Yo lo que tengo es la copia de time machine, el archivo original y otro en otro disco externo que actualizo a menudo para no perder todo en caso una nefasta consecucion de eventos que pudieran hacer perder las fotos de toda una vida, ya sabes, con eso de los mayas uno no sabe a que atenerse

Un saludo